Laboratorium biomolekuler difungsikan untuk menunjang kegiatan praktikum, penelitian, pengabdian kepada masyarakat, dan pengembangan bidang biomolekuler. Lingkup kegiatan diantaranya untuk praktikum mata kuliah teknologi biologi pangan, teknologi biologi industri dan teknologi biologi lingkungan, dan juga untuk penelitian molekuler. Adapun peralatan yang ada didalam laboratorium biomolekuler adalah Real Time PCR, Gel Documentation, Centrifuge Refrigerated, waterbath, freezer hingga Electrophoresis Vertical & Horizontal.